FHRB biobanksstudier
2021
Studiens namn: aCOX-2-autoantikroppar vid hematologiska sjukdomar
Ansvarig forskare: Satu Mustjoki, Hematology Research Unit, Helsingfors universitet
Vårt mål är att ta reda på hur vanliga anti-COX-2 autoantikroppar (aCOX-2-autoantikroppar) är vid hematologiska sjukdomar och vilken klinisk betydelse de har. Genom analys av en stor kohort kan vi definiera aCOX-2-autoantikroppens specificitet vid aplastisk anemi och karakterisera dess användbarhet som ett differentialdiagnostiskt verktyg vid benmärgssviktssjukdomar. I de följande skedena utvidgar vi forsknings-området ytterligare för att bedöma om markören i fråga kan användas för att skilja mellan aplastisk anemi och andra hematologiska sjukdomar. Vårt syfte är också att undersöka om aCOX-2-autoantikroppar är delaktiga i patogenesen för aplastisk anemi.
***
Studiens namn: Användning av teknologin optical genome mapping som cytogenetisk forskningsmetod hos KLL- och MDS-patienter
Ansvarig forskare: Tuomo Mantere, Uleåborgs universitet
Syftet med studien är att utreda om den nya teknologin optical genome mapping (OGM) är lämplig som cytogenetisk testmetod hos KLL- och MDS-patienter. I studien utreds särskilt om det med denna metod är möjligt att identifiera de kromosomavvikelser som identifieras med de nuvarande, klassiska cytogenetiska metoderna samt även nya, eventuellt kliniskt betydelsefulla strukturella varianter (SV).
***
Studiens namn: Läkemedelssensitivitet och genomiska analyser vid mogna T-cellslymfom/leukemier (MaTCL)
Ansvarig forskare: Satu Mustjoki, Hematology Research Unit, Helsingfors universitet
Syftet med studien är att förbättra effekten och säkerheten av läkemedelsbehandling vid T-PLL- och T-LGLL-leukemi. I studien testas läkemedel som redan är i användning samt nya cancerläkemedel baserade på STAT-inhibitorer vid behandling av primär MaTCL.
***
Studiens namn: Epidemiologisk kartläggning av mål för immunterapi vid elakartade myeloida sjukdomar
Ansvarig forskare: Markus Vähä-Koskela, Institutet för molekylärmedicin i Finland (FIMM), Helsinki universitet
Syftet med studien är att förstå hur myelodysplastiska syndrom (MDS) och akut myeloisk leukemi (AML) utvecklas på cellnivå i enskilda celler samt att utreda patienternas lämplighet för nya immunterapier.
***
Studiens namn: FinnGen: Kombinerande av genetiska data och hälsoregister för identifiering av nya potentiella läkemedelsämnen
Ansvarig forskare: Aarno Palotie, Helsinki universitet
FinnGen är ett gemensamt forskningsprojekt för offentlig och privat sektor, vars syfte är att öka förståelsen av genetiska mekanismer som ligger bakom olika sjukdomar samt att utveckla nya läkemedelsbehandlingar genom att kombinera genom- och hälsodata från 500 000 finländare.
***
2020
Studiens namn: Celler som utlöser leukemi i akut myeloisk leukemi: inverkan av hypoxi/HIF-bana på kemoresistens och återfall
Ansvarig forskare: Talia Velasco Hernandez, Josep Carreras Leukaemia Research Institute, Spanien
Syftet med denna studie är att analysera transkriptomi genom encellig RNA-sekvensering av celler som utlöser leukemi i AML-prover för olika specifika cytogenetiska grupper.
***
Studiens namn: DNA-metylering som biomarkör och föremål för behandling i akut lymfoblastleukemi i T-cellerna
Ansvarig forskare: Riikka Lund och Riina Kaukonen, Åbo universitet
Syftet med denna studie är att karaktärisera klonal DNA-metylering och förekomsten av motsvarande RNA då det gäller läkemedelsresistenta/-responsiva fenotyper i T-ALL-patienters celler bland enskilda barn, unga vuxna (19–40 år) och vuxna (över 40 år) för att i DNA-metyleringen identifiera biomarkörer som kan ligga till grund för en prognos av behandlingsresultatet.
***
Studiens namn: Studie om mikroRNA-kontrollerat T-cellsfack med funktionsstörningar i en stamcellsnisch hos patienter som lider av myelodysplastiskt syndrom
Ansvarig forskare: Dagmar Quandt, Institute for Anatomy and Cell Biology, Martin Luther University Halle-Wittenberg, Tyskland
Syftet med denna studie är att identifiera celltypsspecifika (T-celler, progenitorstamceller) mikroRNA-profiler som framkommit på ett avvikande sätt bland patienter som lider av lågrisk- och högrisk-MDS och i icke-MDS-kontroller samt reda ut inverkan av dysregulerat T-cellsfack på uppkomsten och framskridandet av sjukdomen. Det slutliga målet är att föreslå nya behandlingsmetoder som anknyter till mikro-RNA och/eller T-celler och som kan tillämpas för att kontrollera utvecklingen av lågrisk-MDS till högrisk-MDS.
***
Studiens namn: Immunövervakning och avslutande av lenalidomid bland del5q MDS -patienter
Ansvarig forskare: Mikko Myllymäki, Hematology Research Unit Helsinki, Helsingfors universitet
Syftet med denna studie är att analysera (MSD) immunofenotyperna i prover för del5q- myelodysplastiskt syndrom och fastställa deras respons på lenalidomidbehandling.
***
Studiens namn: Benmärgscellernas molekylfingeravtryck, MORE
Ansvarig forskare: Merja Heinäniemi, Biomedicinska enheten, Östra Finlands universitet
Det allmänna syftet med denna studie är att utnyttja benmärgscellernas hela molekylfingeravtryck för exakt identifiering av status för kliniskt relevanta celler.
***
Studiens namn: Roll som Clever-1 har i akut myeloisk leukemi (AML)
Ansvarig forskare: Sirpa Jalkanen, MediCity, Åbo universitet
Syftet med denna studie är att analysera inverkan av Clevege-immunoterapi på AML-cellernas funktion och livsduglighet med hjälp av benmärg som samlats från AML-patienter.
***
2019
Studiens namn: To identify the AML blast population responsible for relapse in FLT3-ITD+/NPM1- AML patients using single cell RNA seq
Ansvarig forskare: Eva Szegezdi, National University of Ireland, Irlanti
Syftet med denna studie är att identifiera vilka cellpopulationer i akut myeloisk leukemi som är involverade i utvecklingen av återfall.
***
Studiens namn: Early detection of relapsed AML in children
Ansvarig forskare: Henrik Hasle, Aarhus University Hospital Skejby, Danmark
Syftet med denna studie är att undersöka möjligheten att följa upp akut myeloisk leukemi hos barn med hjälp av individuella genetiska markörer.
***
Studiens namn: Drug sensitivity testing and molecular profiling of plasma cell dyscrasias to identify novel treatments and the indicators of response
Ansvarig forskare: Caroline Heckman, Institutet för molekylärmedicin i Finland, Helsingfors universitet
Syftet med denna studie är att identifiera nya läkemedel för behandling av multipelt myelom, plasmacellleukemi och amyloidos.
Publikationer som härrör från studien:
Miettinen et al 2021: Aminopeptidase Expression in Multiple Myeloma Associates with Disease Progression and Sensitivity to Melflufen. Cancers 13 (7); 1527. https://doi.org/10.3390/cancers13071527
Liu, Minxia el al 2021: S100 Calcium Binding Protein Family Members Associate With Poor Patient Outcome and Response to Proteasome Inhibition in Multiple Myeloma. Frontiers in Cell and Developmental Biology 9. https://doi.org/10.3389/fcell.2021.723016
***
Studiens namn: The determinants of drug response in acute lymphoblastic leukemia
Ansvarig forskare: Caroline Heckman, Institutet för molekylärmedicin i Finland, Helsingfors universitet
Syftet med denna studie är att förbättra behandlingen av akut lymfatisk leukemi hos barn och unga vuxna.
***
2018
Studiens namn: Genome-wide association study of acute myeloid leukaemia (AML)
Ansvarig forskare: James Allan, Northern Institute for Cancer Research, Newcastle University, Storbritannien
Syftet med denna studie är att hitta nya genvarianter i samband med akut myeloisk leukemi.
***
Studiens namn: Improving outcome for patients with Poor Risk Acute Myeloid Leukaemia
Ansvarig forskare: Jude Fitzgibbon, Barts Cancer Institute, Queen Mary University of London, Storbritannien
Syftet med denna studie är att stärka vår förståelse för olika genetiska och biokemiska faktorer som ligger bakom den akuta myeloiska leukemin vid dålig prognos. Målet är att hitta nya objekt för läkemedel samt markörer för att identifiera vilka patienter som kan få hjälp av dem.
***
Studiens namn: Comprehensive profiling of chronic (CMML) and juvenile (JMML) myelomonocytic leukemia aiming to identify novel targets for treatment
Ansvarig forskare: Satu Mustjoki, Hematology Research Unit Helsinki, Helsingin yliopisto
Syftet med denna studie är att hitta nya behandlingsformer för behandling av kronisk myelomonocytleukemi och myelomonocytleukemi hos ungdomar.
***
Studiens namn: Activity of the peptidase enhanced alkylating agent melflufen in light chain amyloidosis and indicators of response
Ansvarig forskare: Caroline Heckman, Institutet för molekylärmedicin i Finland, Helsingfors universitet
Syftet med denna studie är att förbättra vår förståelse av AL-amyloidosens molekylgenetiska bakgrund och att undersöka användbarheten av läkemedlet Melflufen vid behandling av sjukdomen.
Publikationer som härrör från studien:
Flanagan et al 2022: The Peptide–Drug Conjugate Melflufen Modulates the Unfolded Protein Response of Multiple Myeloma and Amyloidogenic Plasma Cells and Induces Cell Death. HemaSphere 6 (3). https://doi.org/10.1097/HS9.0000000000000687
***
2017
Studiens namn: Assessment of plasma cell content and viability of biobanked multiple myeloma bone marrow samples
Ansvarig forskare: Caroline Heckman, Institutet för molekylärmedicin i Finland, Helsingfors universitetSyftet med denna studie är att bedöma kvaliteten på benmärgsprover som samlats in i en biobank av patienter med multipelt myelom.
***
Studiens namn: Integrated platform of novel glycomic and proteomic approaches to investigate structural and functional changes of blood malignancies including: Multiple Myeloma (MM), Acute Myeloid Leukemia (AML) and Amyloidosis.
Ansvarig forskare: Peter O'Gorman, Mater Misericordiae University Hospital, Irlanti
Syftet med denna studie är att undersöka progressionen av blodcancer och läkemedelsresponsen genom proteom- glykofilering av multipelt myelom, akut myeloisk leukemi och amyloidos.
Publikationer som härrör från studien:
Dowling et al 2021: Identification of Protein Biomarker Signatures for Acute Myeloid Leukemia (AML) Using Both Nontargeted and Targeted Approaches. Proteomes 9 (4); 42. https://doi.org/10.3390/proteomes9040042
***
Studiens namn: Next generation leukemia diagnostics and therapy through p53 isoforms analysis
Ansvarig forskare: Bjørn Tore Gjertsen, University of Bergen, Norja
Syftet med denna studie är att undersöka förekomsten av olika former av p53 proteiner (isoformer) vid primär akut myeloisk leukemi och att bedöma om de kan användas som diagnostiska markörer vid planeringen av behandlingen.
***
2016
Studiens namn: Clonal lymphopoiesis in the pathogenesis of bone marrow failure syndromes
Ansvarig forskare: Satu Mustjoki, Hematology Research Unit Helsinki, Helsingin yliopisto
Syftet med denna studie är att identifiera somatiska mutationer i lymfoida celler hos patienter med aplastisk anemi eller myelodysplastiska syndrom (MDS). De observerade mutationerna karaktäriseras och deras funktionella effekter undersöks. Avsikten är också identifiera nya mål för läkemedel.
Publikationer som härrör från studien:
Lundgren et al 2021: Somatic mutations in lymphocytes in patients with immune-mediated aplastic anemia. Leukemia 35; 1365-1379. https://doi.org/10.1038/s41375-021-01231-3.
***
Studiens namn: Towards curative therapy of Philadelphia chromosome-positive acute lymphoblastic leukemia
Ansvarig forskare: Satu Mustjoki, Hematology Research Unit Helsinki, Helsingin yliopisto
Syftet med denna studie är att hitta nya alternativ för behandling av Philadelphia kromosompositiv akut lymfoblastisk leukemi. Syftet är också att undersöka vilka molekylära och cellspecifika markörer som förutspår bra respons på behandling med tyrosinkinasinhibitorer, för att så tidigt som möjligt identifiera de patienter som inte behöver en stamcellstransplantation.
Publikationer som härrör från studien:
Hohtari et al 2022: Copy number alterations define outcome in Philadelphia chromosome-positive acute lymphoblastic leukemia. Haematologica 107(8):1971-1976. https://doi.org/10.3324/haematol.2021.280578
Hohtari et al 2022: Targeting Apoptosis Pathways With BCL2 and MDM2 Inhibitors in Adult B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia. Hemasphere 6 (3). https://doi:10.1097/HS9.0000000000000701
Hohtari et al 2019: Immune cell constitution in bone marrow microenvironment predicts outcome in adult ALL. Leukemia 33; 1570-1582. https://doi.org/10.1038/s41375-018-0360-1
Dufva et al 2019: Integrated drug profiling and CRISPR screening identify essential pathways for CAR T cell cytotoxicity. Blood 135 (9); 597-609. https://doi.org/10.1182/blood.2019002121
***
Studiens namn: Molecular Genetics and Biology of Myeloproliferative Neoplasms
Ansvarig forskare: Outi Kilpivaara, Forskningsprogrammet för genombiologi, Helsingfors universitet
Syftet med denna studie är att ta reda på hur genetiska faktorer påverkar uppkomsten och den kliniska bilden av myeloproliferative sjukdomar (t.ex. polycytmia vera, essentielli tromobcytos och myelofibros). Syftet är att förbättra diagnostiken och behandlingen av dessa sjukdomar.
***
Studiens namn: Genetics of myelodysplastic syndrome and acute leukemias in Finland – focus on germline variation
Ansvarig forskare: Outi Kilpivaara, Forskningsprogrammet för genombiologi, Helsingfors universitet
Syftet med denna studie är att avgöra hur genetiska faktorer påverkar uppkomsten och den kliniska bilden av myelodysplastiskt syndrom och akut myeloisk leukemi. Ett specifikt forskningsobjekt är ärftliga genetiska faktorer.
Publikationer som härrör från studien:
Wartiovaara-Kautto et al 2018: Germline alterations in a consecutive series of acute myeloid leukemia. Leukemia 32;2282-2285. https://doi.org/10.1038/s41375-018-0049-5
Douglas et al 2019: ERCC6L2 defines a novel entity within inherited acute myeloid leukemia. Blood 133 (25); 2724-2728. https://doi.org/10.1182/blood-2019-01-896233
***
Studiens namn: Assessment of the possibilities of molecular medicine in sensitive diagnostics and personalized therapy response evaluation in myelodysplastic syndromes and related myeloid malignancies (MDS-MOLE-2015)
Ansvarig forskare: Freja Ebeling, Hematologiska polikliniken, HUS
Syftet med denna studie är att förbättra diagnostiken och behandlingen av myelodysplastiska syndrom genom att undersöka genetiska markörer.
***
Studiens namn: A systems medicine study to identify novel therapies for blood cancer patients
Ansvarig forskare: Caroline Heckman, Institutet för molekylärmedicin i Finland, Helsingfors universitet
Syftet med denna studie är att hitta nya behandlingsmetoder och responsindikatorer som mäter behandlingseffekterna för olika former av blodcancer genom att använda bland annat läkemedelskänslighetsprofilering och exome och RNA-sekvensering.
***
2015
Studiens namn: Personalized Systems Medicine Strategy for Acute Myeloid Leukemia
Ansvarig forskare: Olli Kallioniemi, Science for Life Laboratory, Karolinska Institutet, Sverige
Syftet med denna studie är att under laboratorieförhållanden undersöka hur leukemiceller svarar på flera hundra läkemedelssubstanser hos patienter med akut myeloisk leukemi. Resultaten kombineras sedan med cellernas genetiska, transkriptomiska och proteomiska profiler. Syftet är att bättre förstå vilka faktorer som påverkar responsen på behandlingen.
Publikationer som härrör från studien:
Ianevski et al 2021: Patient-tailored design for selective co-inhibition of leukemic cell subpopulations. Science advances 7 (8). https://doi.org/10.1126/sciadv.abe4038
***
Studiens namn: Novel molecular markers for disease activity of acute myeloid leukemia
Ansvarig forskare: Jukka Westermarck, Turun biotekniikan keskus, Turun yliopisto ja Åbo Akademi
Syftet med denna studie är att identifiera nya markörer som kan förutsäga responsen på behandlingen hos patienter med akut myeloisk leukemi, redan vid tidpunkten för diagnosen. Forskargruppen är särskilt intresserad av genetiska markörer.
Publikationer som härrör från studien:
Mäkelä et al 2021: Discovery of a Novel CIP2A Variant (NOCIVA) with Clinical Relevance in Predicting TKI Resistance in Myeloid Leukemias. Clin Cancer Res 27 (10); 2848-2860. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-20-3679
Mäkelä et al 2019: Arpp19 Promotes Myc and Cip2a Expression and Associates with Patient Relapse in Acute Myeloid Leukemia. Cancers 11; 1774. https://doi.org/10.3390/cancers11111774
